1894年9月14日（清光绪二十年，甲午）一岁
9月14日（甲午八月十五日），生于福建闽侯县螺洲（今福州市仓山区螺洲镇）一户寒儒家庭。父吴国琬，举人，母董氏。
原名萃文，字虞薰、湛然。
八岁前在家，由母亲抚育。
1902年（清光绪二十八年，壬寅），九岁
入“帝师”陈宝琛创办的螺洲两等小学旁听。
1904年（清光绪三十年，甲辰），十一岁
乡公学停办，入福州师范学校附属小学，后因病辍学。回乡中学校学习，学业日进。
1910年（清宣统二年，庚戌），十七岁
入福州开智小学堂学习。该校为当时福州地区标榜新学的名校。
1911年（清宣统三年，辛亥），十八岁
春，转入格致书院就读。该校为西方教会创办。
12月，吴石与开智小学堂林炘、郑九鼎等同学出资台伏币百余元，捐助组织福建北伐学生军，并毅然报名参加。
1912年（民国元年，壬子），十九岁
1月17日，吴石随福建学生北伐军出发，乘“万象”号商轮离榕赴沪，在沪参加军训。
2月初，闽、浙学生军奉南京临时政府陆军部之命，汇于南京，合编为南京陆军入伍生队。入伍生队下分两营，福建学生军为第二营，吴石被编入。
2月15日，孙中山携文武官员前往明孝陵祭奠，吴石等入伍生随往护卫。
6月，黄兴辞去南京留守。离职前，黄以陆军部长名义通知陆军入伍生暂时遣散回原籍，等待入武昌第二预备军官学校学习。吴石乘舟回闽等待。
8月，入武昌第二预备军官学校，开始军校生活。
1913年（民国二年，癸丑），二十岁
3月，获悉宋教仁遭暗杀，吴石深感悲愤，约同学回福建参加倒袁运动，因海上交通临时断绝而未成行。
7月，同窗雷彪在秘密参加李烈钧发起的九江起义中被捕牺牲。吴石知情后秘密书写挽联，召集福建、江西同学悼念。
1914年（民国三年，甲寅），二十一岁
12月，在武昌第二预备军官学校以第一名的成绩毕业。
1915年（民国四年，乙卯），二十二岁
吴石入保定陆军军官学校第三期炮科，与张治中、蔡廷锴、宋希濂、白崇禧、黄绍竑、刘建绪等人同班学习，同期闽籍同学有吴仲禧、施泰祯、张贞、许显时、林知渊等，袍泽情谊伴随一生。
1916年（民国五年，丙辰），二十三岁
12月5日，以第一名的成绩从保定军官学校第三期炮科毕业。黎元洪总统莅临毕业典礼致训，校指定吴石为毕业生代表答辞。一时名扬，被誉“吴状元”。
1917年（民国六年，丁巳），二十四岁
4月，回闽参加倒袁驱李（厚基）运动。到厦门鼓浪屿闽南军司令部协助工作，后遭北洋军阀李厚基部追捕，避走广东汕头。
1918年（民国七年，戊午），二十五岁
4月，粤滇军第四师师长方声涛与江西李烈钧合作在广东成立“征闽靖国军”，吴石参加“征闽靖国军”。
1919年（民国八年，己未），二十六岁
应张贞之邀，吴石离开“征闽靖国军”，参加闽南民军。
1920年（民国九年，庚申），二十七岁
重回“征闽靖国军”，任少校参谋。
1922年（民国十一年，壬戌），二十九岁
因喉疾加剧，到北平（现北京）治疗、休养。
1923年（民国十二年，葵亥），三十岁
经族人介绍，跟从在京的闽籍诗词大家何振岱学习，开始喜好词章。
年底，吴石与同乡王碧奎结婚。婚后，吴石与王氏生育六男二女，长幼次序如下：吴美成（长男、已殇）、吴展成（未足岁殁）、吴韶成（三男）、吴康成（四男、已殇）、吴竞成（五男、已殇）、吴兰成（长女）、吴学成（次女）、吴健成（六男）。王碧奎于1993年2月9日逝世于美国洛杉矶，享年90岁。
1924年（民国十三年，甲子），三十一岁
9月17日，第二次直奉战争爆发。10月，直系军阀内部分化，冯玉祥发动北京政变。冬，冯玉祥将军在河南组织国民军，宣布拥护国民革命。应国民军第三军孙岳部参谋长兼第十四师师长何遂之邀，吴石到洛阳就任该师军械处处长，兼统领炮兵。
1925年（民国十四年，乙丑），三十二岁
1月，南苑干部学校成立，吴石兼任上校教官。
1926年（民国十五年，丙寅），三十三岁
国民军在直、奉两军夹击下瓦解。
春，国民革命军在广东组建，誓师北伐。闽南民军张贞部被改编为国民革命军第一军第四师，张贞任师长。吴石离开何遂部应邀赴张贞部任参谋长。不久，国民革命军总部参谋长朱绍良委吴石为作战科长。
秋，去沪闲居。
1927年（民国十六年，丁卯），三十四岁
10月，国民党福建省政府成立。应省政府主席方声涛之邀，吴石回闽任省政府军事厅参谋处处长，致力整理本省民军。
1929年（民国十八年，己巳），三十六岁
6月，由于对时局失望，萌生去日深造的念头。在方声涛帮助下，由福建省政府官费保送日本留学。
冬，考入日本炮兵学校。
1930年（民国十九年，庚午），三十七岁
编辑、刊印个人诗集《东游甲稿》，收入东游日本诗作85篇。
冬，通过严格考试，被日本陆军大学校录取。在校成绩优异，有“十二能人”之誉（即：能文、能武、能诗、能词、能书、能画、能英语、能日语、能骑、能射、能驾、能泳）。
1931年（民国二十年，辛未），三十八岁
9月18日，日本帝国主义武装侵入东北，制造震惊中外的九一八事变，远东战争策源地形成。在日留学的吴石愤然写下《神州》、《时事》、《闻北警感赋》等爱国诗篇。
1932年（民国二十一年，壬申），三十九岁
由故宫印书局出版著作《最新航空述要》，并将书款捐助用于发展我国航空事业。
1934年（民国二十三年，甲戌），四十一岁
夏，从日本陆军大学毕业。举家乘苏联邮轮从东京航行五天抵沪。
回国后，进入国民革命军参谋本部参谋处，研究曰本情报，并兼任陆军大学校战术课教官。
1935年（民国二十四年，乙亥），四十二岁
3月5日，“帝师”陈宝琛在京逝世。吴石以“门下再晚生”名义送去挽联：“先君承香火再传，何期小子跻堂，曾受推恩申矩彟；四海痛老成忽邈，岂但乡人思德，相将洒涕满松榆”，寄托哀思。
编印个人诗集《东游甲乙稿》，共收诗歌254首。其中：1929年至1931年诗作列为甲稿；1932年至1934年诗作列为乙稿。何振岱先生作序，指出：吴石“诗骨清而语洁，览物写景皆有会心，而跃马横戈，悲歌康慨，尤不胜其故国河山之感。盖其身之所经、目之所触至有耿然不能自己者。劳者谣而病者呻，读君诗亦可知其志矣。”
出版个人著作《近代战争与国防之本质》。
1936年（民国二十五年，丙子），四十三岁
2月3日，晋阶国民革命军陆军少将。
由兵学研究会出版专著《兵学辞典粹编》，得到广泛好评，之后再版两次，1937年4月三版发行。商务印务馆发行其译著《警察学纲要》（松井茂著）。
仲夏，陪同恩师何振岱游览南京栖霞寺、嘉兴烟雨楼等吴中名胜。
1937年（民国二十六年，丁丑），四十四岁
历时3年编撰出反映日本军事和军队情况的《参二室蓝皮本》，弥补国民政府对日军事情报研究的缺位。
5月，中共代表团抵达南京。在何遂私宅，经何遂介绍，首次会晤中共代表团叶剑英、李克农等同志，对共产党人有了初步认识。
7月，国民政府中央军事委员会将参谋本部改称第一部，参谋部第二厅改称第二组。吴石任第二组副组长兼第一处处长，从事敌情研究。
8月13日，发生“八一三”事变，淞沪战役开始。吴石奔赴前线视察。
8月20日，国民政府颁发战争指导方案，全国划为五个战区：第一战区为河北及山东北部地区；第二战区为山西、察哈尔、绥远；第三战区为苏南、浙江；第四战区为福建、广东；第五战区为苏北、山东。
1938年（民国二十七年，戊寅），四十五岁
1月，国民政府中央军事委员会最高常务会议决定，军委一部与参谋本部合并，成立军令部。
8月，军令部第二厅指定吴石在武汉主办战地情况参谋训练班，吴石邀请周恩来、叶剑英讲课，其中：周恩来作形势报告、叶剑英讲游击战大课，周、叶的人格魅力给吴石留下深刻印象。吴石作情报素养讲话。
出版军事著作《战术讲话》。
1939年（民国二十八年，己卯），四十六岁
秋，吴石调任桂林行营参谋处长，策划指导长沙、湘桂、桂南、昆仑关、桂柳等会战。
组建福建旅桂同乡会，并出任会长。
牵头创办黄花岗纪念学校。
12月，在吴石等国民党上层人士支持下，在华日人反战同盟西南支部在国民党统治区桂林成立。
与日本进步作家鹿地亘结下终身友谊。
1940年（民国二十九年，庚辰），四十七岁
年底，吴石调任第四战区长官部任参谋长。
8月，在广西桂林与率南洋华侨回国慰劳视察团慰问抗战军民的爱国侨领陈嘉庚会晤，共商抗战大计。
1941年（民国三十年，辛巳），四十八岁
1月4日，新四军军部及所属部队九千余人奉蒋介石命令北移。6日，行至泾县茂林地区时，突遭国民党军八万余人包围袭击。新四军除约两千人突围外，大部壮烈牺牲，军长叶挺下山谈判时被扣押。17日，蒋介石竟反诬新四军“叛变”，宣布取消其番号，并声称要将叶挺交军事法庭审判，制造了震惊中外的“皖南事变”。这是国民党顽固派在抗战时期掀起第二次反共高潮的主要标志。
4月，吴石分别在何遂创作的《长江万里图》长卷题诗，其中题《长江万里图・川江》七律为：“恕无俊语酬风物，如此江山处处幽。杰阁凌虚吞远势，孤城衔日入深秋。四峨隐约云中辨，三水飞腾峡里流。胜地故应人杰萃，摩挱往跡思悠悠。”题在《长江万里图・三峡》七律为：“远览方知天地宽，心安蜀道未为难。香溪初望昭君里，险水又经崆岭滩。艛艓顺流飞鸟过，峰峦当路怒猊蟠。欲探何处闻猿峡，一为停舟着意看。”题在《长江万里图・武汉》七律为：“武昌夏口大江流，廿二年前忆旧游。几度探幽攀古阁，也曾寻醉踏芳洲。孤心郁勃隐双剑，共济安危托一舟。楚客江篱无限感，秋风斜日更添愁。”
12月，吴石以福建旅桂同乡会名义召开座谈会，研究成立“闽台协会”，为台湾回归祖国做准备。
出版著作《重庆见闻录》。
1942年（民国三十一年，壬午），四十九岁
1月22日，晋阶国民革命军陆军中将。
年底，广西镇边（今那坡）县政府要求就地处决所谓“越南籍日本间谍”胡志明，吴石与陈宝仓即示押解柳州长官部。在多方营救下，越共领袖胡志明脱险。
在柳州帮助胡志明组建越南民族同盟会，柳州成为越南人民军武装的基地。
12月，创办军事期刊《国防研究》，研究抗敌新战法。在《国防研究》上发表了《新国防论》、《新战术论》、《今次大战各国战时经济概述》、《论倭第八十一届议会》等一系列文章。
1943年（民国三十二年，癸未），五十岁
中秋，逢吴石五十华诞，好友何遂作《百字令》一词奉赠。词曰：前身谓汝，恰中秋，明月人间能几。收拾乾坤归腕底，吾辈固应如是。多少英雄，古今人物，去去长江水。蓬莱清浅，望中澄澈无际。相与高唱分题，清谈据坐，莫问今何世。且尽平原旬日饮，侧耳羽书闻喜。荡滌倭氛，廓清禹域，方快平生意。老松仙鹤，一声横笛吹起。
1944年（民国三十三年，甲申），五十一岁
任第四战区参谋长、第16集团军副总司令，参加桂柳战役。日军仓皇从南宁撤退，恰司令长官张发奎不在，吴石当机立断，派兵迅速追击，敌人未及进行破坏，地方赖以保护，大获全胜。
8月，日军攻陷衡阳，大举进攻桂林。吴石以兵力不足退守怀远，凭借地理优势，仅用一团兵力，战车数辆，重炮三四门，同日军相持7日。他还亲自部署了桂柳大会战和中越边境保卫战，抗击日寇南下大军和从越南北上侵犯中越边境的日军，以固守反击战术与敌作殊死搏斗，使广西龙州至靖西岳坪中越边境广大地区不被染指。
11月，发生“六寨惨案”，险些丧生。
1945年（民国三十四年，乙酉），五十二岁
3月，出任国民政府军政部主任参事。
秋，在桂林应诗家林北丽之邀，吴石题诗贺其三十初度：“四海滔滔者，斯人气独奇。不求甘淡泊，自得固融怡。世俗那经眼，冲怀只寄诗。智符原在握，底事苦伤时。”
年底，吴石秘密参加三民主义同志联合会。
1946年（民国三十五年，丙戌），五十三岁
1月9日，与好友何遂、陈孝威同游重庆北温泉之缙云山。在汉藏教理院，与何遂诗画合璧，在何遂指画《狮子峰下缙云寺》上题诗：“旧境重咲独勤，任他春已尽三分；笋舆十里松阴路，斜风细雨上缙云。”
5月，国民政府由重庆迁回南京。出任国民政府国防部第五局（即史料局，1947年5月，更名为史政局）中将局长。
目睹国民党政府腐败无能，独裁专政，极为愤懑，常以宴会名义，与挚友刘斐、何遂、刘通等共聚一堂，议论国事。
1947年（民国三十六年，丁亥），五十四岁
1月，中共中央决定在国统区成立中共中央上海分局，刘晓为书记。5月，中共中央上海分局改为上海中央局，负责领导上海、南京等国统区的地下斗争。
2月28日，台湾人民举行武装起义，反抗国民党的反动统治。3月17日，吴石随国防部长白崇禧率领军、政大员（包括蒋经国在内）组成的代表团到台北，调查事件始末，进行“宣慰视察”。在台湾停留三星期后，白崇禧对台湾全省发表广播讲话，宣称国民党对“二二八”事件的处理，将“秉持和平宽大的原则"，军事镇压至此告一段落。事后，白崇禧推荐吴石出任台湾警备司令部司令，未获蒋介石首肯。
4月，经何遂介绍，与中共方面发生联系。中共中央上海分局书记刘晓、副书记刘长胜及负责统战、军运的领导张执一等在上海锦江餐馆与其会面，确定工作关系。之后，张执一多次与吴石见面，进行工作联系。
夏，吴石抄录旧作《登鲤鱼峰》赠重侄吴长芝。诗曰：“不堪回首更登高，独立危峰首屡搔。横插秋原山惨淡，回环古郭水萧萧。轮困轩辕存吾素，际会风云属尔□。□□□□□荔地，赠言来路思忉忉。”鼓励吴长芝为革命多做贡献。
1948年（民国三十七年，戊子），五十五岁
6月，福州地区遭受600年来的最大洪灾。闻讯后，吴石即邀闽籍在南京供职的官员商讨救灾方案，在争取中央政府拨粮救济的同时，发动所有闽籍在京供职官员，捐一月所得，集资赈灾。
吴石为福建才女的刘蘅诗集《蕙愔阁集》作序。
10月，撰写《孙子纪念亭碑记》。
12月，受我党委托，劝说国民党第二舰队司令林遵反正。
1949年（中华人民共和国建立，己丑），五十六岁
2月，吴石调任福州绥靖公署副主任。
2月初，中情部负责人李克农指示上海情报系统，迅速安排东南地区的工作并提出“重点在台、闽”。5月初，上海情报组织派谢筱迺去福州，联系吴石将军，建立福建情报小组及地下电台。
4月，中国共产党代表团与南京政府派出的和平谈判代表团在北平（今北京）举行谈判。
在南京，受我党委托，规劝李宗仁接受中共八项和谈条件。
吴石向我党提供《国防部全国军备部署图》、《沪宁沿线军事部署图》等核心情报。中共中央上海局派人急送苏北解放区，转交中国人民解放军第三野战军。
毛泽东、朱德发布向全国进军的命令，解放军百万雄师于20日子夜强渡长江，摧毁国民党军的长江防线。23日，南京解放，标志国民党统治的崩溃。同曰，国民党第二舰队司令林遵率部起义。
4月30日，与何遂离沪赴广州，约定赴台湾开展策反情报工作。
5月27日，中国当时最大的城市上海解放。
5月，吴石抵榕正式履新。吴石同中共中央社会部福建特派员谢筱迺建立联系，向中共提供重要情报。其中有：蒋介石在京、沪、杭解放后的“全国作战部署”，特别是台湾及东南的部署及国民党军队的军事动向情报；国民党军在福建省的战斗序列、在福建整编后的主官姓名、福建“绥署”的兵力统计等情报。
6月，蒋介石密令福州绥靖公署主任朱绍良在福州外围构筑一道半永久性防御工事。吴石出面做朱的工作，使此事拖延，福州城区免遭战争劫难。
7月下旬，吴石抵香港，向中共华南分局提供了国民政府军事委员会编制的两份绝密材料。一是在长江以南川、滇、湘、黔、粤、闽六省的国民党军队建制和兵力总表；一是国民党军在西北各部队番号、驻军地点等，是我追歼国民党残敌的重要情报。
8月15日，在官邸密召其随从交代将298箱军事档案材料待福州解放后献给福州军管会。8月17日福州解放。
8月16日上午，乘军用专机离榕去台。在台期间，吴石出任国防部参谋次长，甘冒危险，为我党工作。
9月，在吴石帮助下，在台执行任务的何遂安全离开台湾，取道香港回到大陆。
10月，吴石赴港，与中共华东局在港负责人万景光会面，约定联系方式。吴石回台后多次派人向在港我党情报机构报送重要情报。
11月底，中共华东局情报部派出朱枫由港赴台，协助吴石工作。吴石提供国民党军事机关及部队主官名册、国民党东南区驻军番号和人员概数，以及飞机、大炮、坦克的数量等重要情况。
1950年（庚寅），五十七岁
1月29日，中共台湾工委书记蔡孝乾被捕。后叛变，中共台湾地下组织遭受严重破坏。
2月4日处于危险中的朱枫在吴石帮助下搭乘空军飞机撤离台北，隐蔽于仍为国民党控制的浙江定海。2月18日，朱枫在定海被捕。
2月29日，吴石夫人被保密局传讯。
3月1日夜，吴石被捕。同案被囚的还有陈宝仓、聂曦等人。6月10日下午，吴石在台北马场町从容就义。海外报章云吴石将军“临刑从容吟诗”。遗诗为：“天意茫茫未可窥，遥遥世事更难知。平生殚力唯忠善，如此收场亦太悲。五十七年一梦中，声名志业总成空。凭将一掬丹心在，泉下差堪对我翁。”